Institut de Mathématiques de Marseille, UMR 7373




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Séminaire Mathématiques et Algorithmique pour la Biologie des Systèmes (MABioS)

par Baudot Anaïs, Lozingot Eric, Remy Elisabeth, Tichit Laurent - publié le , mis à jour le

Agenda

Séminaire

  • Lundi 28 janvier 11:00-12:00 - Elisa Tonello - Freie Universität Berlin

    Patterns in discrete spatial systems : a Boolean Delta-Notch model

    Résumé : Lateral signalling is a pervasive mechanism capable of explaining cell
    differentiation. Spatial Boolean models of signalling have previously been
    formulated and studied. Because of the inherent combinatorial explosion,
    their computational analysis has proven to be challenging. In this talk,
    we discuss some properties of a Boolean Delta-Notch model in multi-cell
    systems with arbitrary neighbourhood relations. We show that the fixed
    points have a simple characterisation in terms of vertex covers of the
    graph encoding the chosen neighbourhood relation. We then proceed to
    investigate trap spaces and the reachability of fixed points, and
    interpret the results in terms of robustness of patterns. Building on the
    theory of Boolean networks, the approach can serve as a starting point for
    the analysis of more complex models of pattern formation.

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groupe de travail

Manifestation scientifique

Descriptif
Nature Séminaire et Groupe de Travail
Intitulé Mathématiques et Algorithmique pour la Biologie des Systèmes (MABioS)
Responsables Elisabeth Remy & Laurent Tichit
Équipe de rattachement BioMath Alea (BMA) du Groupe ALEA
Fréquence 1 séance chaque semaine
Jour-Horaire Lundi, de 14h à 16h
Lieu Salle de réunion du 3ème étage, I2M, Luminy (accès)
Lien http://mabios.math.cnrs.fr/seminaire.html

Contact : laurent_tichit_AT_univ-amu.fr
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