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URL:https://www.i2m.univ-amu.fr/evenements/branched-transport-and-network-
 formation-in-biology/
SUMMARY:Workshop (CIRM\, Luminy\, Marseille): Branched transport and networ
 k formation in biology
DESCRIPTION:Workshop: \n\nWORKSHOP\n\nBranched transport and network format
 ion in biology\n​Transport branché et formation de réseaux en biologie
 \n\n6 - 10 November 2021\n\n\n\nDescription\n\n\n\n\n\n\n\n\n\n\nThe objec
 tive of this series of meetings is to work on different variational models
  of network formation in biology\, using the theory of branched transport.
  Branched transport is a variant of the classical optimal transport theory
 \, where the displacement cost is no longer linear but sub-additive in the
  mass instead.\n\nAs a first step\, we plan to study different dynamic mod
 els of biological network formation existing in the literature\, which are
  of reaction-diffusion type and include a “sub-additive term”. In part
 icular\, we wish to establish a Γ-convergence type result (for an adequat
 e topology) of these models towards a branched transport model (when the d
 iffusion parameter tends to 0). The behavior of some organisms such as the
  myxomycete (slime mold) Physarum Polycephalum\, in particular in their tr
 ansformation phase from a plasmodium state (diffuse state) to a concentrat
 ed state on a network when optimizing the transport of nutrients\, could b
 e modeled through such variational frameworks.\n\nAs a further step to mod
 el such organisms\, we would like to introduce some material constraints i
 n the model since a part of the mass of the plasmodium itself is used to b
 uild the network. This could translate at the PDE level as the introductio
 n of suitable dissipation terms in the continuity equation.\n\n\n\n\nL’o
 bjectif de cette série de rencontres est de travailler sur différents mo
 dèles variationnels de formation de réseaux en biologie\, en utilisant l
 a théorie du transport branché. Le transport branché est une variante d
 u transport optimal classique\, où le coût de transport n’est plus lin
 éaire mais sous-additif en la masse.\n\nDans un premier temps\, nous comp
 tons étudier certains modèles dynamiques de type réaction-diffusion iss
 us de la littérature\, décrivant la formation de réseaux en biologie et
  comprenant un terme sous-additif”. En particulier\, nous souhaitons ét
 ablir un résultat de type Γ-convergence (pour une topologie adéquate) d
 e ces modèles vers un modèle de type transport branché (lorsque le para
 mètre de diffusion tends vers 0). Le comportement de certains organismes 
 comme le myxomycète Physarum Polycephalum\, notamment dans leurs phases d
 e transformation d’un état de plasmode (diffus) à un état de concentr
 ation sur un réseau afin d’optimiser le transport de nutriments\, pourr
 ait ainsi être modélisé à l’aide de telles formulations variationnel
 les.\n\nDans une nouvelle étape pour modéliser de tels organismes\, nous
  souhaitons introduire dans le modèle des contraintes matérielles puisqu
 ’une partie de la masse du plasmode est utilisée pour construire le ré
 seau. Cela se traduirait au niveau de l’EDP par l’introduction de term
 es de dissipation dans l’équation de continuité.\n\n\n\n\nParticipants
 \nRomain Hug (Aix-Marseille Université)\nAntonin Monteil (Université Par
 is-Est Créteil)\nPaul Pegon (Université Paris-Dauphine CEREMADE)\n[su_sp
 acer size="10"]\nSPONSOR\n\n\n\n\n\n\n\n\n\n\n\n  \nPEPS JCJC\n\n\n\n\n\n[
 su_spacer size="10"]\n\n\n\n\n\n\n
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