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URL:https://www.i2m.univ-amu.fr/evenements/detection-d-outliers-en-grande-
 dimension-application-a-la-genomique-des-populations/
SUMMARY: (...): Détection d'outliers en grande dimension: application à l
 a génomique des populations
DESCRIPTION:: Notre objectif est de détecter quelles sont les variables ou
 tliers dans des jeux de données de grande dimension. Les méthodes de dé
 tection d'outliers sont utilisées en génomique pour détecter quels sont
  les gènes qui permettent aux individus de s’adapter à leur environnem
 ent. Nous proposons une approche rapide basée sur l’analyse en composan
 tes principales. Le principe est de considérer comme gènes candidats ceu
 x qui sont excessivement corrélés avec les composantes principales. Pour
  ce faire\, nous calculons pour chaque marqueur génétique un vecteur qui
  mesure l’association entre un marqueur génétique et les composantes p
 rincipales. Nous utilisons ensuite la distance de Mahalanobis pour trouver
  quels sont les vecteurs atypiques. En utilisant un jeu de données humain
 s comprenant un peu plus d’un millier d’individus et des centaines de 
 milliers de marqueurs génétiques\, nous montrons que cette approche perm
 et de détecter des exemples d’adaptation biologique chez l’homme.http
 ://membres-timc.imag.fr/Michael.Blum/
CATEGORIES:Séminaire,Mathématiques-Évolution-Biologie
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