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URL:https://www.i2m.univ-amu.fr/evenements/evolution-des-genomes-chez-les-
 bacteries-du-super-phylum-planctomycetes-verrucomicrobiae-chlamydia/
SUMMARY:Sandrine Pinos (URMITE - Unité de Recherche sur les Maladies Infec
 tieuses et Tropicales): Évolution des génomes chez les bactéries du sup
 er-phylum Planctomycetes-Verrucomicrobiae-Chlamydia
DESCRIPTION:Sandrine Pinos: La compréhension de l'évolution des génomes 
 est un des enjeux clé de la biologie actuelle. Cela induit l'identificati
 on des événements génétiques affectant les génomes au cours du temps\
 , mais aussi la détermination des relations entre les génomes\, les phé
 notypes et l'environnement des organismes.\nNous avons rédigé une revue 
 de la littérature consacrée à la contribution de la génomique dans la 
 compréhension de la diversité\, de l'évolution et des causes génétiqu
 es de phénotypes d'un super-phylum bactérien appelé super-phylum PVC (p
 our Planctomycetes\, Verrucomicrobiae et Chlamydiae). Ces bactéries provi
 ennent d'environnements variés et présentent des caractéristiques phén
 otypiques particulières\, dont certaines ne sont retrouvées que dans ce 
 groupe. Les analyses génomiques ont révélé la grande diversité de ces
  espèces\, mais ont aussi permis de reconstruire l'évolution de leurs g
 énomes et dans certains cas\, d'expliquer l'apparition de phénotypes par
 ticuliers. Plusieurs caractéristiques morphologiques ou physiologiques re
 stent cependant mal expliquées\, que ce soit leur origine ou leur évolut
 ion\, entre autre à cause du manque de données disponibles. Une partie d
 e notre travail était consacré à l'étude de l'évolution et de l'impac
 t de la présence d'un plan cellulaire particulier chez les bactéries PVC
 . Ce plan cellulaire est sujet a différentes interprétations et induirai
 t la compartimentation des cellules en deux régions distinctes dont l'une
  contiendrait le nucléoside. Les résultats obtenus semblent indiquer que
  cette caractéristique n'affecte pas les génomes bactériens\, sa foncti
 on reste donc pour l'instant indéfinie. En revanche les observations micr
 oscopiques réalisées sur deux espèces ont permis de mieux appréhender 
 l'évolution de ce plan cellulaire. Si le phénotype ne semble pas\, ou pe
 u\, avoir d'impact sur les génomes bactériens\, nous avons détecté en 
 revanche une contribution de l'environnement concernant la sélection des 
 gènes transférés. Il semblerait que les gènes transférés soient en e
 ffet sélectionnés selon leurs fonctions par les différents environnemen
 ts.\nNos travaux ont donc permis d'améliorer la compréhension des relati
 ons entre l'évolution\, les phénotypes et l'environnement\, en particuli
 er chez les bactéries du super-phylum PVC\, fournissant ainsi de nombreus
 es pistes de travail qui pourront être approfondie dans le futur.\n\nMots
  clés :\n*Membres du jury :\n- Didier Raoult (directeur de thèse\, URMIT
 E\, UMR7278\, Marseille)\n- Pierre Pontarotti (co-directeur)\,\n- Gilbert 
 Greub\,\n- Pascal Simonet.\n\nLiens :\n- theses.fr\n- ED62
CATEGORIES:Soutenance de thèse,Mathématiques-Évolution-Biologie
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