BEGIN:VCALENDAR VERSION:2.0 PRODID:-//wp-events-plugin.com//7.2.3.1//EN TZID:Europe/Paris X-WR-TIMEZONE:Europe/Paris BEGIN:VEVENT UID:1470@i2m.univ-amu.fr DTSTART;TZID=Europe/Paris:20161205T133000 DTEND;TZID=Europe/Paris:20161205T150000 DTSTAMP:20241209T083332Z URL:https://www.i2m.univ-amu.fr/evenements/le-defi-evolutif-du-changement- climatique-processus-adaptatifs-chez-le-corail-rouge-corallium-rubrum/ SUMMARY:Marine Pratlong (Observatoire des Sciences de l’Univers - Institu t Pythéas - Institut méditerranéen de la biodiversité et d’écologie marine et continentale): Le défi évolutif du changement climatique\, pr ocessus adaptatifs chez le corail rouge (Corallium rubrum) DESCRIPTION:Marine Pratlong: Le changement climatique actuel affecte déjà différents composants de la biodiversité\, des gènes aux écosystèmes . En Méditerranée\, le corail rouge (Corallium rubrum) présente un impo rtant rôle écologique dans les écosystèmes benthiques de substrat dur. Il subit d'importantes pressions anthropiques de par sa valeur économiqu e directe (exploitation)\, et indirecte (attrait pour la plongée récréa tive). Il a récemment été touché par des événements de mortalité li és à des anomalies thermiques. Par ailleurs\, les conditions environneme ntales\, et notamment thermiques extrêmement contrastées que cette espè ce subit sur l'ensemble de son aire de répartition\, en font un modèle i ntéressant pour l'étude de l'adaptation locale. J'ai donc cherché\, au cours de ma thèse\, à comprendre les bases génétiques des différences de thermotolérance chez le corail rouge. Dans un premier temps\, nous a vons confirmé que les différences d'expressions de gènes étaient maint enues au cours du temps\, en absence de stress thermique chez des individu s issus de profondeurs différentes à Marseille. Certains des gènes iden tifiés\, présentant des fonctions pertinentes et déjà décrites pour l a réponse au stress chez les cnidaires\, sont de bons candidats pour l'é tude de l'adaptation locale et de forts arguments en faveur de la conserva tion de cette fonction chez les cnidaires. Afin d'identifier d'éventuelle s bases génétiques de l'adaptation locale chez le corail rouge\, nous av ons mis en place un protocole d'échantillonnage de paires de populations `surface vs profondeurs' dans trois régions géographiques différentes s uivi d'un séquençage via RAD-Séquençage. L'analyse de la structure gé nétique neutre indique une connectivité réduite entre les populations d e surface et à fois populations de surface et les populations profondes q ui pourrait limiter les capacités de recolonisation des populations les p lus exposées aux pressions du changement global. En ce qui concerne les l ocus sous sélection\, plusieurs obstacles méthodologiques ont été renc ontrés dans leur détection chez cette espèce à forte structure génét ique. En gardant à l'esprit ces biais possibles\, nous avons identifié u n signal probable d'adaptation locale à Marseille et en Corse\, sans qu'u ne convergence dans les gènes ou les fonctions candidats n'ait été obse rvée. L'analyse de la structure génétique chez le corail rouge a condui t à l'identification de marqueurs génétiques du sexe qui correspond à la première description chez une espèce non-bilatérienne. Cette observa tion confirme l'intérêt du corail rouge en tant que modèle en biologie évolutive et intégrative.En conclusion\, cette thèse complète les conn aissances biologiques écologiques et génétiques que nous avons chez l'e spèce emblématique qu'est le corail rouge. Nous apportons ici une premi ère étude de l'adaptation locale et du déterminisme génétique du sexe chez cette espèce. De nouvelles approches pourront être mises en place pour continuer à explorer l'adaptation locale du corail rouge à la profo ndeur\, notamment à la lumière d'un génome\, ou d'un point de vue plus axé sur le phénotype.\n\nMots clés : Corail rouge\, Sélection\, Adapta tion locale\, Changement climatique\, Déterminisme génétique du sexe\, Connectivité.\n\nAbstract:\nThe on-going climate change should have major impacts on the different components of biodiversity\, from genes to ecosy stems. The Mediterranean red coral (Corallium rubrum) has an important eco logical role in Mediterranean benthic ecosystems and is submitted to major anthropic pressures because of its direct (exploitation) and indirect (at tractivity for recreational scuba-diving) economical values. This species has recently been impacted by mortality events linked with thermal anomali es. Because of the extremely contrasted thermal conditions it deals with a long his range the red coral is an interesting model for the study of loca l adaptation. During my thesis\, I tried to understand the genetic basis o f thermotolerance differences in the red coral. We first confirmed that ge ne expression differences were maintained along time\, in absence of therm al stress in individuals from different depths in Marseille. Some of these genes presented relevant functions which were already described in the st ress response in cnidaria and were good candidates for the study of local adaptation and strong arguments supporting the conservation of this functi on in cnidaria.In order to identify potential genetic basis of the local a daptation in the red coral\, we built a sampling design of pairs of `shall ow vs deep' populations in three geographical regions and sequenced via RA D-Sequencing the corresponding individuals. The analysis of neutral geneti c structure of the studied populations highlighted a limited connectivity of shallow populations with both shallow populations and deep populations that could counteract recolonization abilities of population the most expo sed to global change. Several methodological obstacles have been met in th e detection of loci under selection in such strongly structured species. B y keeping in mind these potential biases\, we highlighted a potential sign al of local adaptation in Marseille and Corsica\, without any convergence in candidate genes and functions. The analysis of the genetic structure of the red coral led us to the identification of sex genetic markers which i s the first description in a non-bilaterian species. This observation conf irms that the red coral is an interesting model for evolutionary and integ rative biology. In conclusion\, this thesis completes ecological and biolo gical genetic knowledge we have for the red coral. Here we provide a first study of local adaptation and genetic sex determination in this species. New approaches will be implemented to further explore the local adaptation of red coral to depth\, particularly in light of a genome\, or a more foc used view of the phenotype.\n\nKey words: Red coral\, Selection\, Local ad aptation\, Climate change\, Genetic determinism of sex\, Connectivity\n\nL ien : theses.fr CATEGORIES:Soutenance de thèse END:VEVENT BEGIN:VTIMEZONE TZID:Europe/Paris X-LIC-LOCATION:Europe/Paris BEGIN:STANDARD DTSTART:20161030T020000 TZOFFSETFROM:+0200 TZOFFSETTO:+0100 TZNAME:CET END:STANDARD END:VTIMEZONE END:VCALENDAR