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URL:https://www.i2m.univ-amu.fr/evenements/methodes-informatiques-de-detec
 tion-de-convergence-evolutive/
SUMMARY: (...): Méthodes informatiques de détection de convergence évolu
 tive
DESCRIPTION:: On parle de convergence lors de l’apparition indépendante 
 d’un même caractère (une apomorphie) dans l’histoire évolutive de p
 lusieurs taxons. D’un point de vue biologique\, ce phénomène est extr
 êmement important parce qu’il permet d’observer des répétitions ind
 épendantes de la genèse d’un même caractère phénotypique\, ce qui r
 end possible la détermination de parties du génome qui y sont impliquée
 s. En effet\, sous l’hypothèse que la convergence d’un caractère don
 né a une base moléculaire et dépend d’un ensemble de sites à identif
 ier\, on peut s’attendre à ce que pour l’un des sites à l’appariti
 on du caractère\, les espèces le portant tendent à évoluer indépendam
 ment vers un même acide aminé \; l’évolution des autres espèces n’
 étant pas contrainte. Nous nous proposons de détecter de tels sites à p
 artir des séquences actuelles et leur arbre phylogénétique dans le cas 
 d’un caractère binaire.La détection de signatures moléculaires de la 
 convergence a été étudié dans plusieurs travaux\, notamment ces derni
 ères années [Zhang and Kumar\, 1997\, Parker et al.\, 2013\, Foote et al
 .\, 2015]. Nous proposons ici une approche originale basée sur une mesure
  du niveau de convergence.Webpage
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