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 utyrophilines-par-l-etude-de-leur-evolution-et-de-leur-variabilite-genetiq
 ue/
SUMMARY:Hassnae Afrache (CRCM\, Aix-Marseille Université): Prédiction de 
 la fonction des butyrophilines par l'étude de leur évolution et de leur 
 variabilité génétique
DESCRIPTION:Hassnae Afrache: \n\nThèse de doctorat en Pathologie humaine. 
 Oncologie\n\n\n\n\nSous la direction de Daniel Olive et de Laurent Abi-Rac
 hed.\n\n\n\n\nSoutenue le 10-10-2014\n\nà Aix-Marseille \, dans le cadre 
 de  Ecole Doctorale Sciences de la Vie et de la Santé (Marseille) \, en p
 artenariat avec  Centre de Recherche en Cancérologie de Marseille (CRCM) 
 (laboratoire) .\n\n\n\n\nLe président du jury était Pascal Rihet.\n\nLe 
 jury était composé de Daniel Olive\, Laurent Abi-Rached\, Pascal Rihet\,
  Henri-Jean Garchon\, Pierre Boudinot\, Nicolas Bierne.\nLes rapporteurs 
 étaient Henri-Jean Garchon\, Pierre Boudinot.\n\nDans le cadre de cette t
 hèse nous nous sommes intéressés à l'étude de l'évolution et de la v
 ariabilité génétique de la famille des butyrophilines (BTN)\, des réce
 pteurs de la superfamille des immunoglobulines impliqués dans la régulat
 ion de la réponse immunitaire. Par une étude phylogénétique approfondi
 e nous avons caractérisé chez les mammifères 14 groupes phylogénétiqu
 es résultant d'une série de duplications à partir de huit gènes ancest
 raux à la base des thériens. Par la suite\, nous avons étudié l'évolu
 tion des BTN de la région CMH chez les primates et leur variabilité gén
 étique dans les populations humaines par une analyse minutieuse des donn
 ées de séquençage générées du projet 1000 Genomes pour plus de 1600 
 individus à travers le monde. Nous avons montré que l'évolution du gèn
 e BTNL2 est marquée par une pression de sélection positive diversifiante
  chez les mammifères qui est accompagnée chez les hominoïdes d'un nivea
 u de polymorphisme élevé induisant la formation de variants tronqués de
  BTNL2. Chez l'homme\, quatre lignages d'allèles ont été identifiés. I
 ls ont été maintenus à des fréquences intermédiaires par une forte s
 élection balancée. D'autre part\, l'analyse phylogénétique détaillée
  du groupe BTN3 (BTN3A1\, 3A2 et 3A3) a montré la présence d'une évolut
 ion concertée\, caractérisée par une homogénéisation forte et récurr
 ente de la région codant pour le peptide signale et le domaine IgV chez l
 es hominoïdes\, au cours de laquelle les séquences de 3A1 et 3A3 sont re
 mplacées par la séquence de 3A2. Chez l'homme\, ces gènes sont polymorp
 hismes important avec plus de 46 allèles chacun\, mais avec la présence 
 d'une homogénéisation extrême des séquences du domaine IgV.\n\n\nhttps
 ://www.theses.fr/2014AIXM5032
CATEGORIES:Soutenance de thèse,Mathématiques-Évolution-Biologie
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