Franck DELAPLACE – Contrôlabilité de l’interactome

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Date/heure
Date(s) - 03/02/2020
15 h 00 min - 16 h 00 min

Emplacement
Site Sud, Luminy, TPR2, Amphithéâtre Herbrand 130-134 (1er étage)

Catégories


Franck DELAPLACE (Université d’Evry)

CONTRÔLABILITÉ DE L’INTERACTOME

La médecine de réseau  est un domaine émergent, définissant la maladie comme les résultat d’une perturbation du  réseau moléculaire. Ainsi,  la transition entre cellule saine et malade ou inversement   s’interprète comme  une  reprogrammation  induite par des perturbations topologiques de l’interactome conduisant au  changement du destin cellulaire. La modélisation a pour enjeu  d’inférer ces actions topologiques contrôlant la modification de cette destinée.

En se fondant sur le cadre formel des  réseaux   Booléens contrôlés, nous proposons une méthode d’inférence  selon un principe abductif déduisant de l’effet ses causes parcimonieuses, les actions topologiques. Ce cadre de modélisation s’applique à priori à un grand nombre de situations biologiques de reprogrammation du destin cellulaire. Dans l’exposé nous aborderons  les aspects fondamentaux de ce cadre et leur application aux maladies complexes.

CONTROLABILITY OF THE INTERACTOME

Network medicine is an emerging field, defining disease as the result of a perturbation of the molecular network. The transition between healthy and diseased cells or vice versa is interpreted as a reprogramming induced by topological perturbation of the interactome altering the  cell fate. The issue is to infer these topological actions controlling the modification of this destiny.

Based on the formal framework of controlled Boolean networks, we propose an inference method based on  abductive principle deducing from the effect the parsimonious causes that are the  topological actions. This modeling framework can be applied   to a large number of celle fate reprogramming situations. In the presentation we will discuss the fundamental aspects of this framework and the applications to complex diseases.

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