Journée annuelle du GT Bioss (2016, 2ème édition)

JOURNEE ALEA-BMA-MABIOS
Salle Conférence, 1, place de l'École, Lyon
http://bioss-cnrs.fr/manif/jnbioss_201607/jnbioss201607.html

Date(s) : 01/07/2016 - 02/07/2016   iCal
Toute la journée

La deuxième édition des journées annuelles du GT Bioss va se dérouler à la suite des Journées ouvertes de biologie, informatique et mathématiques (JOBIM) organisées par la Société française de bio-informatique (SFBI). Ainsi, les 1er et 2 juillet 2016, les membres du GT auront le plaisir de se rencontrer autour de conférences autour des thèmes suivants :
– la modélisation stochastique en biologie ;
– la régulation génétique ;
– le métabolisme.

Organisateurs

Olivier Gandrillon, Cédric Lhoussaine, Élisabeth Remy (I2M), Sylvain Sené et Anne Siegel

Orateurs invités

Grégory BATT, INRIA Saclay
Marcelline KAUFMAN, Université libre de Bruxelles
Marie-France SAGOT, INRIA Lyon

Programme

Vendredi 1er juillet

09h00 – 09h30Accueil
09h30 – 09h45Introduction des journées
09h45 – 10h30Conférence plénière – Grégory Batt – Predicting long-term effects of apoptosis-inducing drug treatments: coupling signal transduction pathways with stochastic protein turnover models
10h30 – 11h00 – Bertrand Miannay – Identification des voies de signalisation impliquées dans le myélome multiple par programmation par contrainte
11h00 – 11h30 – Arnaud Bonnaffoux – Toward a dynamic multi-scale/level approach for gene regulatory network inference
11h30 – 12h00 – Nicolas Schabanel – Folding Turing is hard but feasible
12h00 – 13h30Pause déjeuner
13h30 – 14h15Conférence plénière – Marie-France Sagot – Species interactions from a metabolism perspective
14h15 – 14h45 – Nils Giordano – Dynamical allocation of cellular resources as an optimal control problem
14h45 – 15h15 – Victorien Delannée – A modeling approach to evaluate the balance between bioactivation and detoxification of MeIQx in human hepatocytes
15h15 – 15h45Discussion Bioss / GDR
15h45 – 16h15Pause
16h15 – 16h45 – Hugues Berry – Estimating the effects of spatial non-homogeneities in intracellular diffusion-reactions
16h45 – 17h15 – Dan Goreac – Hybrid designing using stochastic backward equations
17h15 – 17h45 – Guillaume Madelaine – Structural simplifications of reaction networks: the confluence problem
17h45 – 18h15 – Ferdinanda Camporesi – Context-sensitive flow analyses: a hierarchy of model reductions

Samedi 2 juillet

09h00 – 09h45Conférence plénière – Marcelline Kaufman – On multistationarity in chemical reaction networks
09h45 – 10h15 – Kévin Perrot – On the flora of asynchronous locally non-monotonic Boolean networks
10h15 – 10h45 – Élisabeth Remy – Discrete dynamics of compound regulatory circuits
10h45 – 11h00Pause
11h00 – 11h30 – Loïc Paulevé – Around reachability in automata networks
11h30 – 12h00 – Emna Ben Abdallah – Inference of biological regulatory networks from time series data
12h00 – 12h30 – Adrien Richard – Points fixes dans les réseaux booléens monotones

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