Manuela ROYER-CARENZI

Maître de Conférences

à l'Université d'Aix-Marseille

Institut de Mathématiques de Marseille
(I2M) UMR 7373

Equipe BioMath Alea (BMA), groupe thématique Mathematiques, Evolution, Biologie

Equipe Statistiques (STA)

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Université d'Aix-Marseille
Case 19, place Victor Hugo
13331 Marseille Cédex 3
France
Mail
: manuela.royer-carenzi@univ-amu.fr

Tél : 04.13.55.12.04

 

Formation et Cursus

Thèse

Thématiques

Livres

Publications

Vulgarisation

Enseignement

 


Formation et Cursus

Poste de Maître de Conférences à l'Institut de Mathématiques de Marseille, UMR CNRS 7373, Université d'Aix-Marseille
(depuis le 1er septembre 2007)

Poste de Maître de Conférences au Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive, UMR CNRS 5558, Université de Lyon 1 (2005-2007)

Poste d'ATER au Laboratoire de Science Actuarielle et Financière de l'ISFA, EA 2429, Université de Lyon 1 (2004-2005)

Poste d'ATER au Laboratoire de Mathématiques Appliquées du Havre,

IUT de Caucriauville et ISEL, Université du Havre (2003-2004)

Doctorat de Probabilités, Institut de Recherche Mathématiques de Rennes, UMR CNRS 6625, Université de Rennes 1 (2000-2003)

DEA de Mathématiques Fondamentales et Applications, filière Probabilités, à l'Université de Rennes 1 (2000)

Agrégation de Mathématiques (1999)

Ecole Normale Supérieure de Cachan, Mathématiques (1998-2000)

Recherche

THESE

Thèse effectuée sous la direction de Ying Hu, au sein de l'Equipe Processus stochastiques et statistiques de l'IRMAR

à l'université de Rennes (soutenue le 1er décembre 2003).

Sujet de thèse

        Equations Différentielles Stochastiques Rétrogrades et martingales non linéaires

THEMES de RECHERCHE

  Equations Différentielles Stochastiques Rétrogrades

  • Horizon aléatoire, sauts
  • Espérance non linéaire
  • Grossissement de filtration (initial et progressif)

Applications en finance

  Collaboration avec le laboratoire SAF (EA 2429), ISFA, Université de Lyon 1

  • Stratégie d'un agent informé dans le cadre d'options américaines
  • Asymétrie d'information, modélisation du risque de défaut

Applications en biologie

           Collaboration avec le laboratoire LBBE (UMR CNRS 5558), Equipe Ecologie Evolutive des Populations, Université de Lyon 1

  • Etude des déplacements d'animaux munis de colliers GPS, lien avec l'habitat
  • Comparaison des modèles probabilistes discrets et continus
  • Equations Différentielles Stochastiques
  • Statistiques théoriques et appliquées (analyse multivariée, séries temporelles)

Au sein du laboratoire I2M (UMR CNRS 6206), Equipe Mathématiques, Evolution, Biologie, Université d'Aix-Marseille

  • Reconstruction ancestrale, utilisation du registre fossile
  • Modèles Markoviens continus sur un arbre phylogénétique
  • Processus de naissance et de mort

LIVRES

 BOUTAHAR Mohamed, ROYER-CARENZI Manuela

Méthodes en séries temporelles et applications avec R,

Ellipses, Références Sciences (2019)

PUBLICATIONS

       ROYER-CARENZI Manuela, DIDIER Gilles

Testing for correlation between traits under directional evolution,

Journal of Theoretical Biology (482) (2019)

       CHABROL Olivier, ROYER-CARENZI Manuela, PONTAROTTI Pierre, DIDIER Gilles

Detecting the molecular basis of phenotypic convergence,

Methods in Ecology and Evolution (9) (2018), n.11, pp. 2170-2180

         ROYER-CARENZI Manuela, DIDIER Gilles

A comparison of ancestral state reconstruction methods for quantitative characters ,

Journal of Theoretical Biology (404) (2016), pp. 126-142

         FAURE Eric, ROYER-CARENZI Manuela

La distribution de l'allèle CCR5-Delta32 résulte-t-elle d'une rupture de pathocénose due à l'expansion romaine ? ,

Chapitre dans le livre : Le concept de pathocénose de M. D. Grmek, Partie II - Applications historiques nouvelles (1) Périodes antique, médiévale et moderne, Ecole Pratique des Hautes Etudes, Sciences Historiques et Philologiques - V, (Eds. J. Coste, B. Fantini, L. Lambrichs) (109) (2016), pp. 159-179

         ROUCAUTE Emeline, PICHARD Georges, FAURE Eric, ROYER-CARENZI Manuela

Analyses of the causes of spawning of large-scale, severe malarial epidemics and their rapid total extinction in western Provence, historically a highly endemic region of France (1745-1850) ,

Malaria Journal, vol. (13) (2014), n.72, pp. 1-42

         HERNANDEZ-LOPEZ Antonio, CHABROL Olivier, ROYER-CARENZI Manuela, MERHEJ Vicky, PONTAROTTI Pierre, RAOULT Didier

To Tree or Not to Tree ? Genome-Wide Quantification and Reticulate Evolution during the Diversification of Strict Intracellular Bacteria,

Genome, Biology and Evolution (5) (2013), n.12, pp 2305-2317.

         ROYER-CARENZI Manuela, PONTAROTTI Pierre, DIDIER Gilles

Choosing the best ancestral character state reconstruction method,

Mathematical Biosciences (242) (2013), pp 95-109.

         DIDIER Gilles, ROYER-CARENZI Manuela, LAURIN Michel

The reconstructed evolutionary process with the fossil record,

Journal of Theoretical Biology (315) (2012), pp 26-37.

         MERHEJ Vicky, NOTREDAME Cédric, ROYER-CARENZI Manuela, PONTAROTTI Pierre, RAOULT Didier

The rhizome of life : the sympatric Rickettsia felis paradigm demostrates the random transfer of DNA sequences,

Molecular Biology and Evolution (28) (2011), n.11,

         BLANCHET-SCALLIET Christophette, EYRAUD-LOISEL Anne, ROYER-CARENZI Manuela

Hedging of defaultable contingent claims using BSDEs with uncertain time horizon,

Bulletin Français d'Actuariat (10) (2010), n.20, juin-décembre 2010, pp. 102-139

         DRAY Stéphane, ROYER-CARENZI Manuela, CALENGE Clément

The exploratory analysis of autocorrelation in animal-movement studies,

Ecological Research (25) (2010), pp.673-681

         EYRAUD-LOISEL Anne, ROYER-CARENZI Manuela

BSDE with random terminal time under enlarged filtration; American-style options hedging by an insider,

Random Operators and Stochastic Equations (18) (2010), n.2, pp. 141-163

         MERHEJ Vicky, ROYER-CARENZI Manuela, PONTAROTTI Pierre, RAOULT Didier

Massive comparative genomic analysis reveals convergent evolution of specialized bacteria,

Biology Direct (4) (2009), n.13, pp. 1-25

         CALENGE Clément, DRAY Stéphane, ROYER-CARENZI Manuela

The concept of animals' trajectories from a data analysis perspective,

Ecological Informatics (4) (2009), pp. 34-41

         FAURE Eric, ROYER-CARENZI Manuela

Is the European spatial distribution of the HIV-1-resistant CCR5-D32 allele formed by a breakdown of the pathocenosis due to the historical Roman expansion ?,

Infection, Genetics and Evolution, vol. (8) (2008), pp. 864-874

         BONENFANT Christophe, GAILLARD Jean-Michel, DRAY Stéphane, LOISON Anne, ROYER Manuela, CHESSEL Daniel

Testing sexual segregation and aggregation: old ways are best ,

Ecology (88) (2007), n.12, pp. 3202-3208

         EYRAUD-LOISEL Anne, ROYER Manuela

Credit-Risk modelling and BSDE with uncertain horizon,

Cahier de recherche de l'ISFA, WP2035 (2006)

         EYRAUD-LOISEL Anne, ROYER Manuela

BSDE with random terminal time under Enlarged Filtration, and Financial Applications,

Cahier de recherche de l'ISFA, WP2034 (2006)

         ROYER Manuela

BSDEs with jumps and related non linear expectations,

Stochastic Processes and their Applications, vol. (116) (2006), pp. 1358-1376

        ROYER Manuela

BSDEs with a random terminal time driven by a monotone generator and their links with PDEs,

Stochastics and Stochastics Reports, vol. (76) (2004), n.4, pp. 281-307

VULGARISATION et AUTRE

  • 2019 Publication du livre Méthodes en séries temporelles et applications avec R , M. Boutahar et M. Royer-Carenzi, Références Sciences, Ellipses (2019).
  • Février 2016 Co-organisatrice du Mois thématique de Statistiques au CIRM Extrêmes - Copules - Actuariat (semaine 4).
  • 2014-2018 Co-encadrement de la thèse de Olivier Chabrol, avec G. Didier et P. Pontarotti Mise en place de méthodes informatiques pour la détection de convergence génomique
  • Décembre 2013 Co-auteur (avec Christophe Dutang) de l'article Une bouffée d'R pour les actuaires publié dans le Journal des actuaires, rubrique Assurance.
  • Octobre 2013 Organisation et pilotage de la Conférence Vous étouffez avec SAS ? Prenez une bouffée d'R,  AG2R La Mondiale, Paris.
  • Depuis 2011 Contributrice du module Stratigraphic Tools de Mesquite
  • 2008-2010 Membre du Comité d'Organisation des Journées de Statistique
  • Juin 2009 Participation à la Formation Continue Initiation SST pour obtenir le diplôme de Sauveteur Secouriste du Travail
  • Avril 2009 Formatrice aux Journées d'analyse statistique des données sur R organisées par la Fédération de Recherche ECOREV,

Séries Temporelles

  • Depuis 2007 Co-auteur du package adehabitatLT et contributrice du package adehabitat (Analysis of animal movements) du logiciel R
  • Depuis 2006 Co-formatrice (Arthur Charpentier, Manuela Royer-Carenzi) pour le stage intensif biannuel organisé par le centre de recherche Caritat

Statistique d'Assurance sous R , Modélisation, Simulation

  • 2005-2009 Contributrice du site de ressources pédagogiques http:pbil.univ-lyon1.fr/R/enseignement.html
  • Octobre 2006 Co-formatrice (J. Confais, S. Dray, M. Royer, G. Saporta) lors du stage intensif organisé par le centre de recherche Caritat

Statistique Multivariée d'assurance, Analyse des données, Discrimination, Classification

Enseignement

Maître de Conférences à l'Université de Marseille

Depuis le 1er septembre 2007, je suis nommée Maître de Conférences à l'Université d'Aix-Marseille, au sein de l'Institut de Mathématiques de Marseille (UMR 7352).

Licence de Biochimie et Biocellulaire (3ème année)

        Proba-Stats Niveau 2, Responsable d'UE

DUT Hygiène, Sécurité, Environnement (HSE) (1ère année)

        Modèles mathématiques (Modèles exponentiel et logistique, Equations différentielles)

        Probabilités et statistiques, applications avec Excel.

Master BioInformatique, Biochimie Structurale et Génomique (2ème année)

        Modèles Markoviens en Phylogénie, Responsable d'UE

Master Mathématiques Appliquées, Statistique (MAS) (1ère année)

        Séries chronologiques, applications avec R, Co-responsable d'UE

De nombreuses fiches d'enseignement se trouvent sur le site http:pbil.univ-lyon1.fr/R/enseignement.html

Maître de Conférences à l'Université de Lyon 1

  • J'ai été nommée Maître de Conférences à l'Université de Lyon 1, au sein du laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive (UMR 5558) de septembre 2005 à aout 2007.

ISFA, Master Ingénierie Mathématique à finalité professionnelle (1ère année)

  • Analyse Multivariée des données, applications avec R, Responsable d'UE

ISFA, Master Ingénierie Mathématique à finalité professionnelle (2ème année)

  • Séries temporelles, applications avec R, Responsable d'UE

STAPS, Master Spécialité Intervention et Gestion en Activité Physique et Adaptée (1ère année)

  • Statistique inférentielle, applications avec R.

Master Ecologie-Ecologie microbienne-Evolution (1ère année)

Parcours Ecologie-Evolution-Biométrie, Bioévaluation Ecosystèmes

       Analyse et Modélisation des systèmes biologiques

IUT, Génie Biologique, (1ère année)

  • Statistiques

SV (Sciences de la Vie), Licence 1ère année

  • Travaux Tutorès d'Analyse et de Statistiques

Dernière mise à jour: 8 avril 2022