¤Modélisation statistique des signaux électrophysiologiques
Modèle mixte, Classification,
Analyse discriminante matricielle, Méthode du maximum d’entropie sur la moyenne(MEM)
Approche
spatio-temporelle du Maximum d’Entropie sur la Moyenne (MEM) pour le problème
inverse en MEG
Depuis environ un an et demi,
avec Bruno Torresani (I2M) et Jean-Marc Lina (CRM-Montréal), nous nous
intéressons au problème inverse de localisation de sources en
magnéto-encéphalographie (MEG) dans une situation de grande dimension où le
temps et l'espace sont
considérés conjointement. Nous
développons une approche spatio-temporelle de la méthode du maximum d'entropie
sur la moyenne (MEM), initialement proposée par Gamboa et Gassiat (1997). Cette méthode MEM a déjà été
utilisée dans le contexte de la localisation de sources par Lina et al.
(2014). Nous travaillons à l’extension
de leur travail en prenant en compte la corrélation temporelle du bruit et des
sources, la principale difficulté étant l'énorme dimension du problème.
Modélisation
statistique des signaux électrophysiologiques
En collaboration avec B. Burle
(Laboratoire de Neurosciences Cognitives (LNC)), B. Torrésani (I2M) et J.
Spinnato (doctorante I2M jusqu’en août 2015) nous avons développé des
modèles pour des signaux cérébraux et
des algorithmes d'estimation et classification correspondants, notamment en vue
d’application aux interfaces cerveau-machine. Nous nous sommes intéressés à la
mise en œuvre de modèles intégrant des sources de variabilité diverses et à
leur validation sur des données réelles.
Publication
Detecting Single-trial EEG Evoked Potential using a Wavelet Domain Linear Mixed Model:
Application to Error Potentials classification.
J. Spinnato, M-C Roubaud, B. Burle et B. Torrésani, Journal Of Neural Engineering, vol. 12 p.036013
(2015) [https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01161911v1]
Communications
-Analyse discriminante matricielle descriptive : Application à l'etude de signaux EEG
J. Spinnato, M-C Roubaud, M. Perrin, E. Maby 2, J. Mattout, B . Burle et B. Torrésani, 47èmes
journées de Statistique, SFdS, Lille (Juin 2015). [http://www.hal.inserm.fr/hal-01161902]
- Finding EEG space-time-scale localized features using matrix-based penalized discriminant analysis,
J. Spinnato, M-C Roubaud, B. Burle et B. Torrésani, IEEE International Conference on Acoustics, Speech,
and Signal Processing (ICASSP), Florence, Italy (Mai 2014) [https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00989928v1]
Encadrement:
De novembre 2011 à juillet 2015 : Participation à l'encadrement de la thèse de Juliette Spinnato :
Modèle de covariance pour l'analyse et la classification de signaux électroencéphalogrammes
soutenue le 6 juillet 2015 à l'université d'Aix-Marseille
Mars-sept 2011: Encadrement avec B. Burle et L. Casini du laboratoire de Neurosciences Cognitives
(LNC) et B. Torresani (I2M) du stage de recherche M2 de Juliette Spinnato :
Modélisation des signaux
électrophysiologiques par le modèle linéaire mixte
: application à la détection des ondes d'erreurs
¤ Analyse statistique des données génomiques
Les données considérées sont principalement issues du transcriptome dans le cadre du cancer.Publications dans des revues internationales
- The chemosensitivity to
therapy of childhood early B acute lymphoblastic leukemia could be
determined
by the combined expression of CD34, SPI-B and BCR genes
L. Talby, H.
Chambost(*), M-C. Roubaud(*), C. N'Guyen, M.
Milili, B. Loriod, C. Fossat, C. Picard,
J. Gabert, P. Chiappetta, G. Michel et C.
Schiff, Leukemia Research (2006) Jun;30(6):665-76
(*) contribution équivalente des deux auteurs
-Blind
Source Separation and the Analysis of Microarray Data,
P.
Chiappetta, M-C. Roubaud and B. Torrésani, J. Comp. Biol., 11:6 (2004), 1090-1109
Congrés
-A New
Approach for Merging Gene Expression Datasets
M-C Roubaud and B. Torresani, IEEE
Workshop on Statistical Signal Processing, Nice, (Juin 2011)
- Approche variationnelle pour la fusion de jeux de données d'expression génique
M-C Roubaud et B. Torresani, Dans 41èmes journées de Statistique, SFdS, Bordeaux (2009) [http://hal.archives-ouvertes/inria-00386695]
-A First Approach based on Detection Call to Analyse Affymetrix GeneChips
C. Pouet, M-C. Roubaud, Y. Zhou and J. Gabert, Poster, JOBIM'06 conference (Juillet 2006).
-Séparation de Sources pour l'Analyse
de Données d'Expression,
P.
Chiappetta, M.C. Roubaud and B. Torrésani, Proceedings
of the JOBIM'02 conference (2002).
- Classification Mixte pour l'Analyse
de Données d'Expression,
P.
Chiappetta, M.C. Roubaud and B. Torrésani, Proceedings
of the JOBIM'02 conference (2002).
Rapport technique
- Merging microarray datasets,
M.C. Roubaud et B. Torrésani (2012) [https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01221006/]
¤ Modélisation statistique des données en Sciences Sociales
Analyse multiniveau, Classification
Collaboration avec Myriam de Loenzien (Démographe, IRD-CEPED)
Communications
- Deficiencies and Transition to Adulthood:
Lessons from the Last Census in Viet Nam,
M. de Loenzien et MC Roubaud présenté à Morbidité et mortalité aux âges adultes (Chaire Quetelet), Louvain-la-Neuve (2012) .
- Physical, Mental Impairment and Illiteracy : Which Spatial Inequalities for Female Adolescents ? A multilevel Exploratory Study , M. de Loenzien et MC Roubaud, A. Ben Charif et C. Rhodes présenté à Fourth International Conference on Vietnamese Studies, Hanoi (2012).
Encadrement :
Encadrement de nombreux travaux d'étudiants, projets et stages en entreprise notamment en Master
MASS (première et seconde année) et co-encadrement de plusieurs mémoires de recherche avec des membres de
l'UMR ESPACE , de l’équipe POP-Santé du LPED-IRD ainsi qu'avec Myriam De Loenzien
(CEPED/IRD).
Mars-Sept 2011: Encadrement avec M. de Loenzien (IRD) du stage de Recherche (M2) de Baptiste Demoulin:
Acceptabilité du dépistage du VIH/SIDA lors des visites prénatales.Une analyse multiniveau.
Filtrage
stochastique linéaire et non linéaire
:
Thème
de recherche principal jusqu'en 2001
abordé sur le plan théorique, numérique avec
application à l'Océanographie (Assimilation de données
satellitaires - Modélisation probabiliste)
Publications dans des revues internationales
-Asymptotic Optimality of Approximate Filters in Stochastic Systems with
Colored Noises,
A.
Le Breton, M.C. Roubaud,
SIAM Journal of
Control and Optimization,
Vol. 39, No 3, pp. 917-927, 2000.
-General approach
to filtering with fractional Brownian noises -Application to linear systems,
M.
L. Kleptsyna, A. Le Breton, M. C. Roubaud,
Stochastics and
Stochastics Reports, Vol. 71, pp. 119-140, 2000.
-Parameter Estimation
and Optimal Filtering for Fractional Type Stochastic Systems
M.
L. Kleptsyna, A. Le Breton, A. , Roubaud,
Statistical Inference
for Stochastic Processes,
Vol. 3, 173-182, 2000.
-A singular
Evolutive Extended Kalman Filter for Data Assimilation in Oceanography,
D.T.
Pham, J.Verron, M.C. Roubaud
Journal of Marine Systems, 16, pp. 323-340,1998.
-Discrete-Time Piecewise
Linear Filtering with small Observation Noise,
P.
Milheiro de Oliveira, M.C. Roubaud,
IEEE Transactions
on Automatic Control,V 40, I12, 1995.
-Filtrage lin\'eaire par morceaux avec petit bruit
d'observation,
M.C.
Roubaud,
Applied Mathematics
& Optimization, 32 pp 163-194, 1995.
-Discrete-Time Piecewise
Linear Filtering with small Observation Noise,
P.
Milheiro de Oliveira, M.C. Roubaud,
IEEE Transactions
on Automatic Control,V 40, I12, 1995.
-An approximate filter for a partially observed piecewise
linear system with small observation noise,
M.C.
Roubaud,
Systems & Control
Letters, 20 pp 239-247, 1993
Congrès avec actes
-Approximate Filters in Stochastic Systems with Colored Noises,
A. Le Breton, M.C. Roubaud,
Proceedings
of the 30th International Symposium on Mathematical Theory of Networks
and Systems, Perpignan, Juin 2000.
-An
Elementary Approach to Filtering in Systems with Fractional Brownian Observation
Noise,
M.
L. Kleptsyna, A. Le Breton, A. , Roubaud,
Proceedings of the 7th Conference on Probability Theory, Vilnius
, Aout 1998, in Probability Theory and Mathematical Statistics,
B. Grigelionis et al. (Eds), pp 373-392, 1999.
-Discrete-Time Piecewise Linear Filtering with small Observation
Noise,
P. Milheiro de Oliveira, M.C. Roubaud,
Proceedings
of the 30th IEEE Transactions on Automatic Control,V
40, I12, 1995.
-Finite
Dimensional approximate filters in the case of high signal-to-noise ratio,
E. Pardoux, M.C. Roubaud,
Conference in Honor of Moshe Zakai, Haifa, Juin 1991, in Stochastic
Analysis, Academic Press INC, 1991.
-General
Piecewise Linear Filtering with Small Observation Noise,
E. Pardoux, M.C. Roubaud,
Proceedings of the 28th IEEE Conference on Control and Decision , Tampa,
déc 1989.
Congrès sans actes
-XXXIème Journées
de Statistique, Grenoble du 17 au 21 mai 1999 (poster: Rudiments de
calcul stochastique fractionnaire et
applications statistiques)
-XIX Rencontres Franco-Belge, Marseille du 19 au 21 nov. 1998 (exposé
: Une approche du type innovation pour le filtrage linéaire
avec bruits browniens fractionnaires)
-Journées SMAI/MAS, Sophia-Antipolis, du 16 au 18 sept. 1998
(exposé : Filtrage dans des systèmes linéaires avec
bruits
browniens fractionnaires)
Rapports
-Asymptotic Optimality of Approximate Filters in Stochastic Systems with
Colored Noises,
A.
Le Breton, M.C. Roubaud,
Rapport
de Recherche INRIA N 3801,
Nov. 1999.
-An
Elementary Approach to Filtering in Systems with Fractional Brownian Observation
Noise,
M.
L. Kleptsyna, A. Le Breton, A. , Roubaud,
Rapport de Recherche INRIA N 3439, Juin 1998.
-Asymptotic Behaviour of Reduced-Order Filters,
A.
Le Breton, M.C. Roubaud,
Rapport
de Recherche INRIA N 3801, Déc. 1997.
-A singular Evolutive
Extended Kalman Filter for Data Assimilation in Oceanography,
D.
T. Pham, J. Verron, M.C. Roubaud,
Rapport
LMC/IMAG N 162, 1996.
-Assimilation
of Altimeter Data using a Quasi-Geostrophic Model and the Extended
Kalman Filter
D. T. Pham, J. Verron, M.C. Roubaud,
Rapport
LMC/IMAG RT 141,
Grenoble, 1995.
-Filtrage
linéaire par morceaux en temps discret avec petit bruit d'observation,
P. Milheiro de Oliveira, M.C. Roubaud,
Rapport de
Recherche INRIA N 1451, Juin 1991.