Fabien Raphel – Simulation et apprentissage statistique de signaux biomédicaux pour la pharmacologie de sécurité.
Fabien Raphel
INRIA Paris
https://team.inria.fr/commedia/fabien-raphel/
Date(s) : 01/12/2020 iCal
14h00 - 15h00
La pharmacologie de sécurité est une branche déterminante de la pharmacologie pour l’étude de nouvelles molécules. Elle intervient dès les premières phases (in vitro) du cycle de vie d’un possible futur médicament. Actuellement, le patch clamp est la technique de référence afin d’étudier l’impact des molécules sur l’activité électrique des cellules cardiaque. Elle est en revanche relativement lente et coûteuse. Un nouveau dispositif (MEA) permet d’assurer un criblage à haut débit des molécules à tester sur des tissus cardiaques. Ces nouveaux signaux électriques obtenus via le MEA restent cependant peu compris. Nos études portent sur 3 points essentiels:
– La simulation de ces signaux pour en améliorer la compréhension et enrichir une base de donnée expérimentale.
– Le développement d’un algorithme de réduction de dimension orienté de manière à maximiser un score de classification.
– Un algorithme de construction de la base d’apprentissage directement basé sur le score de classification.
Nous verrons que ces trois points nous assurent une bonne classification des signaux biomédicaux tout en étant peu paramétriques.
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