Contrôlabilité de l’interactome – Franck Delaplace
Franck Delaplace
IBISC, Université d'Evry
https://www.ibisc.univ-evry.fr/~delapla/
Date(s) : 03/02/2020 iCal
15h00 - 16h00
CONTRÔLABILITÉ DE L’INTERACTOME
La médecine de réseau est un domaine émergent, définissant la maladie comme les résultat d’une perturbation du réseau moléculaire. Ainsi, la transition entre cellule saine et malade ou inversement s’interprète comme une reprogrammation induite par des perturbations topologiques de l’interactome conduisant au changement du destin cellulaire. La modélisation a pour enjeu d’inférer ces actions topologiques contrôlant la modification de cette destinée.
En se fondant sur le cadre formel des réseaux Booléens contrôlés, nous proposons une méthode d’inférence selon un principe abductif déduisant de l’effet ses causes parcimonieuses, les actions topologiques. Ce cadre de modélisation s’applique à priori à un grand nombre de situations biologiques de reprogrammation du destin cellulaire. Dans l’exposé nous aborderons les aspects fondamentaux de ce cadre et leur application aux maladies complexes.
Network medicine is an emerging field, defining disease as the result of a perturbation of the molecular network. The transition between healthy and diseased cells or vice versa is interpreted as a reprogramming induced by topological perturbation of the interactome altering the cell fate. The issue is to infer these topological actions controlling the modification of this destiny.
Based on the formal framework of controlled Boolean networks, we propose an inference method based on abductive principle deducing from the effect the parsimonious causes that are the topological actions. This modeling framework can be applied to a large number of celle fate reprogramming situations. In the presentation we will discuss the fundamental aspects of this framework and the applications to complex diseases.
Emplacement
I2M Luminy - TPR2, Amphithéâtre Herbrand 130-134 (1er étage)
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